MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021081	TGA	2	6	172872	172877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881825
3502	NC_021081	GCC	2	6	173069	173074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881826
3503	NC_021081	ACC	2	6	173100	173105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881826
3504	NC_021081	CCT	2	6	173113	173118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881826
3505	NC_021081	GAAGCG	2	12	173129	173140	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482881826
3506	NC_021081	GCT	2	6	173161	173166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881826
3507	NC_021081	GTGG	2	8	173170	173177	0 %	25 %	75 %	0 %	482881826
3508	NC_021081	CTG	2	6	173191	173196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881826
3509	NC_021081	CAT	2	6	173225	173230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881826
3510	NC_021081	CCA	2	6	173245	173250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881826
3511	NC_021081	CTC	2	6	173308	173313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881827
3512	NC_021081	G	6	6	173348	173353	0 %	0 %	100 %	0 %	482881827
3513	NC_021081	CAA	2	6	173432	173437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881827
3514	NC_021081	GTG	2	6	173478	173483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881827
3515	NC_021081	GAG	2	6	173497	173502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881827
3516	NC_021081	CCCAG	2	10	173533	173542	20 %	0 %	20 %	60 %	482881827
3517	NC_021081	CGG	2	6	173650	173655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881827
3518	NC_021081	GCA	3	9	173665	173673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3519	NC_021081	GGA	2	6	173686	173691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881827
3520	NC_021081	C	6	6	173723	173728	0 %	0 %	0 %	100 %	482881827
3521	NC_021081	CTG	2	6	173782	173787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3522	NC_021081	GCC	2	6	173817	173822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881827
3523	NC_021081	AGC	3	9	173859	173867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3524	NC_021081	GGC	2	6	173921	173926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881827
3525	NC_021081	CAG	2	6	173969	173974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3526	NC_021081	G	6	6	174010	174015	0 %	0 %	100 %	0 %	482881827
3527	NC_021081	AGC	2	6	174054	174059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3528	NC_021081	CCA	2	6	174082	174087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881827
3529	NC_021081	TGA	2	6	174091	174096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881827
3530	NC_021081	CCA	2	6	174127	174132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881827
3531	NC_021081	C	7	7	174148	174154	0 %	0 %	0 %	100 %	482881827
3532	NC_021081	TCG	2	6	174192	174197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881827
3533	NC_021081	CCA	2	6	174208	174213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881827
3534	NC_021081	GGCG	2	8	174276	174283	0 %	0 %	75 %	25 %	482881828
3535	NC_021081	GCC	2	6	174296	174301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881828
3536	NC_021081	CTCG	2	8	174309	174316	0 %	25 %	25 %	50 %	482881828
3537	NC_021081	GCCGG	2	10	174391	174400	0 %	0 %	60 %	40 %	482881828
3538	NC_021081	AGGCC	2	10	174459	174468	20 %	0 %	40 %	40 %	482881828
3539	NC_021081	CCG	2	6	174480	174485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881828
3540	NC_021081	CCCAGG	2	12	174509	174520	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482881828
3541	NC_021081	GGTA	2	8	174554	174561	25 %	25 %	50 %	0 %	482881828
3542	NC_021081	CAG	2	6	174589	174594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881828
3543	NC_021081	GCG	2	6	174644	174649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881828
3544	NC_021081	TCCT	2	8	174652	174659	0 %	50 %	0 %	50 %	482881828
3545	NC_021081	GGT	2	6	174745	174750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881828
3546	NC_021081	GCC	2	6	174788	174793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881828
3547	NC_021081	CCG	2	6	174807	174812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881828
3548	NC_021081	TGC	3	9	174822	174830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881828
3549	NC_021081	CAC	2	6	174841	174846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881828
3550	NC_021081	GTTGG	2	10	174874	174883	0 %	40 %	60 %	0 %	482881828
3551	NC_021081	TCC	2	6	174894	174899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881829
3552	NC_021081	CCA	3	9	174922	174930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881829
3553	NC_021081	CGG	2	6	175015	175020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881829
3554	NC_021081	GGC	2	6	175127	175132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881829
3555	NC_021081	C	6	6	175206	175211	0 %	0 %	0 %	100 %	482881829
3556	NC_021081	AGC	2	6	175221	175226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881829
3557	NC_021081	TGA	2	6	175237	175242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881829
3558	NC_021081	GCCCCG	2	12	175247	175258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881829
3559	NC_021081	GA	3	6	175285	175290	50 %	0 %	50 %	0 %	482881829
3560	NC_021081	CCT	2	6	175324	175329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881829
3561	NC_021081	GAT	2	6	175370	175375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881829
3562	NC_021081	GTT	2	6	175382	175387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881829
3563	NC_021081	GCC	2	6	175413	175418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881829
3564	NC_021081	GCC	2	6	175440	175445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881829
3565	NC_021081	CGG	2	6	175528	175533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881829
3566	NC_021081	CGATGG	2	12	175576	175587	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482881829
3567	NC_021081	CCT	2	6	175661	175666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881830
3568	NC_021081	CCAGG	2	10	175693	175702	20 %	0 %	40 %	40 %	482881830
3569	NC_021081	GCC	3	9	175725	175733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881830
3570	NC_021081	GTA	2	6	175756	175761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881830
3571	NC_021081	CAC	2	6	175831	175836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881830
3572	NC_021081	GAG	2	6	175898	175903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881830
3573	NC_021081	GGC	2	6	176019	176024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881830
3574	NC_021081	AGGGC	2	10	176157	176166	20 %	0 %	60 %	20 %	482881830
3575	NC_021081	GC	3	6	176186	176191	0 %	0 %	50 %	50 %	482881830
3576	NC_021081	GTAA	2	8	176214	176221	50 %	25 %	25 %	0 %	482881830
3577	NC_021081	AC	3	6	176244	176249	50 %	0 %	0 %	50 %	482881830
3578	NC_021081	GGCC	2	8	176252	176259	0 %	0 %	50 %	50 %	482881830
3579	NC_021081	CGCC	2	8	176279	176286	0 %	0 %	25 %	75 %	482881830
3580	NC_021081	CCA	2	6	176316	176321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881830
3581	NC_021081	GGCC	2	8	176361	176368	0 %	0 %	50 %	50 %	482881830
3582	NC_021081	CAG	2	6	176392	176397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881830
3583	NC_021081	TCG	2	6	176408	176413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881830
3584	NC_021081	AGG	2	6	176423	176428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881830
3585	NC_021081	GCT	2	6	176553	176558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3586	NC_021081	GGC	3	9	176693	176701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3587	NC_021081	CTGGGC	2	12	176747	176758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881831
3588	NC_021081	CCCA	2	8	176786	176793	25 %	0 %	0 %	75 %	482881831
3589	NC_021081	GCCA	2	8	176844	176851	25 %	0 %	25 %	50 %	482881831
3590	NC_021081	TGG	2	6	176902	176907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881831
3591	NC_021081	TTG	2	6	176913	176918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881831
3592	NC_021081	CAG	2	6	176954	176959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3593	NC_021081	CGC	2	6	176971	176976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881831
3594	NC_021081	GC	3	6	176996	177001	0 %	0 %	50 %	50 %	482881831
3595	NC_021081	AGCC	3	12	177051	177062	25 %	0 %	25 %	50 %	482881831
3596	NC_021081	GAG	2	6	177063	177068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881831
3597	NC_021081	TGGG	2	8	177103	177110	0 %	25 %	75 %	0 %	482881831
3598	NC_021081	G	6	6	177108	177113	0 %	0 %	100 %	0 %	482881831
3599	NC_021081	AGC	2	6	177120	177125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3600	NC_021081	GTT	2	6	177137	177142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881831
3601	NC_021081	A	6	6	177188	177193	100 %	0 %	0 %	0 %	482881831
3602	NC_021081	CTG	2	6	177209	177214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3603	NC_021081	TGG	2	6	177244	177249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881831
3604	NC_021081	CCA	2	6	177277	177282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881831
3605	NC_021081	CGG	2	6	177306	177311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3606	NC_021081	GGC	2	6	177332	177337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3607	NC_021081	ATCA	2	8	177446	177453	50 %	25 %	0 %	25 %	482881831
3608	NC_021081	CCG	2	6	177456	177461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881831
3609	NC_021081	TTC	2	6	177533	177538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881831
3610	NC_021081	GGT	2	6	177542	177547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881831
3611	NC_021081	GGC	2	6	177604	177609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3612	NC_021081	TGG	2	6	177649	177654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881831
3613	NC_021081	CAG	2	6	177659	177664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3614	NC_021081	CGG	2	6	177691	177696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3615	NC_021081	TGC	2	6	177747	177752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3616	NC_021081	GGC	2	6	177809	177814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3617	NC_021081	GC	3	6	177820	177825	0 %	0 %	50 %	50 %	482881831
3618	NC_021081	GCA	2	6	177856	177861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881831
3619	NC_021081	GGGGCC	2	12	177927	177938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881831
3620	NC_021081	GGTC	2	8	177970	177977	0 %	25 %	50 %	25 %	482881831
3621	NC_021081	GC	3	6	177994	177999	0 %	0 %	50 %	50 %	482881831
3622	NC_021081	CCT	2	6	178054	178059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881832
3623	NC_021081	CCG	2	6	178150	178155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881832
3624	NC_021081	CCG	2	6	178171	178176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881832
3625	NC_021081	GCC	2	6	178188	178193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881832
3626	NC_021081	GCA	2	6	178240	178245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881832
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3628	NC_021081	GAA	2	6	178295	178300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881832
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3633	NC_021081	CCT	2	6	178417	178422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881832
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3853	NC_021081	AAG	2	6	188332	188337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881841
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3856	NC_021081	CAG	2	6	188521	188526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
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3985	NC_021081	TCA	2	6	197032	197037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881848
3986	NC_021081	GCG	2	6	197099	197104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881848
3987	NC_021081	GCT	2	6	197105	197110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881848
3988	NC_021081	CCGC	2	8	197128	197135	0 %	0 %	25 %	75 %	482881848
3989	NC_021081	TGG	2	6	197182	197187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881848
3990	NC_021081	GTG	2	6	197235	197240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881848
3991	NC_021081	GGT	2	6	197318	197323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881848
3992	NC_021081	G	7	7	197324	197330	0 %	0 %	100 %	0 %	482881848
3993	NC_021081	CGG	2	6	197368	197373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881848
3994	NC_021081	GTG	2	6	197463	197468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881848
3995	NC_021081	CGC	2	6	197498	197503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881848
3996	NC_021081	CAG	2	6	197509	197514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881848
3997	NC_021081	GCG	2	6	197533	197538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881848
3998	NC_021081	CAT	2	6	197627	197632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881848
3999	NC_021081	GCC	2	6	197649	197654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881848
4000	NC_021081	AGG	2	6	197701	197706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881848

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